Nueva prueba analiza todos los genes de Identificación única mutación que causa enfermedades raras

Audrey Lapidus adoraba soleados sonrisa y hoyuelos irresistibles de su bebé, pero empezó a preocuparse cuando Calvino no rodó encima o arrastrarse a los 10 meses y sufrió problemas digestivos crónicos. Cuatro neurólogos despedidos de sus síntomas y una batería de pruebas no fueron concluyentes. Desesperado por respuestas, Audrey y su marido accedió a que su hijo se convierta en primer paciente de la UCLA para someterse a una nueva y poderosa prueba llamada secuenciación del exoma.

Utilizando el ADN recogido de Calvino y sus padres de sangre, una máquina de secuenciación sofisticado escanea rápidamente genoma del chico, lo comparó con su padres y marcado una variante en su 18 cromosomas. Calvino fue diagnosticado con Síndrome de Pitt-Hopkins, un raro trastorno genético que afecta a unos 250 niños en todo el mundo. A Audrey pasado y su marido tenían un diagnóstico concreto y una dirección clara para buscar el mejor tratamiento para su hijo.

Ahora, un estudio de la UCLA hito presenta un argumento convincente para el uso clínico de rutina de la secuenciación del exoma como una herramienta valiosa para el diagnóstico de los niños como Calvin con trastornos genéticos raros. Publicado el 18 de octubre en línea por la revista de la Asociación Médica de Estados Unidos, los resultados muestran que la secuenciación del exoma produjo un diagnóstico definitivo en el 40 por ciento de los casos más complejos de la UCLA – un salto cuántico de la tasa de éxito del 5 por ciento del campo de hace dos décadas.

“Nuestro estudio es el primero en mostrar que la secuenciación del genoma de un niño junto con sus padres ‘mejora dramáticamente genetistas’ capacidad para llegar a un diagnóstico de certeza en enfermedades raras”, dijo el autor correspondiente Dr. Stan Nelson, vicepresidente de la genética humana y un profesor de patología y medicina de laboratorio en la Escuela David Geffen de Medicina en UCLA. “Descubrimos una causa genética para las enfermedades que afectan a un 40 por ciento de los cientos de niños pequeños que acuden a la UCLA para la secuenciación del exoma, debido a retrasos en el desarrollo o discapacidad intelectual.”

El Clinical Genomics Center de UCLA fue establecido en 2011 como una de las tres instalaciones en el mundo (incluyendo Baylor y Harvard) para poner la secuenciación de ADN para uso clínico.

A diferencia de los diagnósticos anteriores que estudian un gen a la vez, esta prueba tamiza rápidamente a través de todos los pares de 37 millones de bases de 20.000 genes de una persona para desentrañar el cambio de ADN única que causa un trastorno genético poco común. Se centra en el exoma, las porciones codificantes de proteínas de los genes que dan cuenta de sólo el 1 por ciento del ADN, pero casi el 85 por ciento de los problemas técnicos que se sabe causan enfermedades humanas.

En este estudio de dos años, Nelson trabajó con el primer autor Hane Lee, profesor adjunto asistente de patología, para secuenciar y analizar los exomas de 814 niños cuyos síntomas habían desconcertado a los médicos anteriores a pesar de las pruebas genéticas, bioquímicas y de imagen exhaustivos.

Así es como funcionaba. El centro de la UCLA canalizó los datos en bruto de la secuenciación de los genomas de cada niño y de sus padres a través de su cartera de informática para identificar las variantes del genoma humano estándar. Exoma de la persona promedio contiene más de 20.000 variantes, casi todas benignas.

A continuación, el equipo aplicó una serie de filtros para los datos en base a los antecedentes familiares del paciente y otros aspectos relevantes de su condición. Los investigadores cazados para todos los genes y las mutaciones ligadas por la literatura médica para los síntomas del paciente. Por último Consejo de datos genómica de la UCLA, un equipo multidisciplinario de expertos, revisó los resultados para llegar a un diagnóstico.

El tiempo típico de respuesta es menos de ocho semanas, aunque los resultados de las pruebas han sido devueltos a los médicos dentro de 10 días en situaciones médicamente urgentes. Con autorización previa, muchos proveedores de seguros cubren el costo de secuenciar un niño y ambos padres. Si no, la tarifa fuera de su bolsillo se ejecuta $ 6,650.

Audrey Lapidus dice que el tener un diagnóstico para Calvin “significaba el mundo.” Un ex periodista, investigó el trastorno ampliamente, puso en marcha la Fundación Pitt-Hopkins Investigación y ayudó a recaudar $ 1 millón para financiar estudios en seis universidades. Ella es una apasionada defensa de la secuenciación del exoma para los padres y los médicos, que a menudo no informan a las familias que la prueba está disponible.

Comprender el origen de la enfermedad de Calvin también llevó un precio emocional. Síndrome de Pitt-Hopkins puede causar retraso en el desarrollo intelectual, retraso motor, problemas respiratorios y convulsiones. Ahora un adorable 3 años de edad, Calvin todavía no puede caminar y nunca puede hablar. Aún así, Lapidus y su marido prefieren saber qué esperar de su hijo y planificar el futuro de continuar viviendo en el limbo de diagnóstico.

“Todas las familias merecen un diagnóstico claro de la condición de su hijo,” dijo el Dr. Wayne Grody, director de la Clínica Genómica Centro de UCLA y profesor de patología, genética humana y pediatría en la Escuela David Geffen de Medicina en UCLA y del Hospital Infantil Mattel de UCLA . “Secuenciación Exoma juega un papel importante en la identificación de la causa exacta de la enfermedad de un niño. Esto es de utilidad inmediata para las familias y los médicos en la comprensión de cómo se produjo la enfermedad, evitando pruebas innecesarias, y el desarrollo de las mejores estrategias para el tratamiento de la misma.”

La Clínica Genómica Centro ofrece una amplia pre y post-test de consejería genética para guiar a las familias a través de las pruebas y prepararlos para los resultados. El equipo también coordina la atención multidisciplinar con especialistas de la UCLA para hacer frente a las complicaciones médicas asociadas con la enfermedad de cada niño.

“Muchos padres de un niño con un trastorno genético posponer el embarazo por temor a tener un hijo con la misma enfermedad”, dijo Naghmeh Dorrani, asesor genético. “Secuenciación Exoma puede aliviar esta preocupación por ayudarnos a identificar el riesgo de recurrencia y ofrecer a los padres opciones de pruebas prenatales adecuados.”

“Muchos padres de un niño con un trastorno genético posponer el embarazo por temor a pasar la misma enfermedad a los niños futuros”, dijo Naghmeh Dorrani, UCLA asesor genético. “Secuenciación Exoma puede aliviar esta preocupación por ayudarnos a identificar el riesgo de recurrencia y ofrecer a los padres opciones de pruebas prenatales adecuados.”

Fuente: medicalnewstoday.com

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